计算分析确定垂体腺瘤中的侵袭相关基因
垂体腺瘤是常见的良性肿瘤,可能导致生长障碍,生殖功能和皮质醇生成。手术切除是大多数症状性垂体腺瘤的首选治疗方法。然而,由于广泛的局部侵袭,很难切除完整的肿瘤。虽然不是恶性的,但侵袭性垂体腺瘤能够渗入周围组织,包括硬脑膜,颅骨或蝶窦。在手术时观察到的侵袭占垂体腺瘤的高达35%。相比之下,垂体转移是罕见的。在鉴定转移之前,侵袭性垂体腺瘤在临床上仍然难以区分。因此,已经进行了许多尝试来定义与侵袭性腺瘤相关的分子标志物。已显示成纤维细胞生长因子受体4基因在体内动物模型中诱导垂体肿瘤侵袭, 并伴有降低的钙粘蛋白表达。与非侵袭性垂体肿瘤相比,浸润性肿瘤中基质金属蛋白酶的基因表达更高。值得注意的是,到目前为止,尚未鉴定出单一标记物可靠地预测肿瘤的行为,以及这种生物标志物是否能够改善临床管理并且最终结果仍有待阐明。
已经开发出微阵列技术以在单个实验中同时测量数千个基因的表达。在过去的几年中,来自微阵列实验的许多原始数据集已经存放在公共主要数据库中,例如国家生物技术信息中心基因表达综合体和欧洲分子生物学实验室 -欧洲生物信息学研究所。因此,研究人员能够通过进行全面的计算分析来重用资源。在本研究中,从国家生物技术信息中心基因表达综合体数据库中检索侵入性垂体腺瘤的微阵列表达谱,并使用计算生物信息学分析管道鉴定侵入相关基因。该基因标记为侵袭性垂体腺瘤的治疗提供了新的诊断生物标志物和治疗靶标。
在本研究中,从国家生物技术信息中心基因表达综合体数据库中检索微阵列实验的原始强度文件。在预处理之后,用于鉴定侵袭性垂体腺瘤中的差异表达基因。随后,使用垂体瘤进行途径影响分析。与其他基因集富集技术相比,该方法考虑了重要的生物学方面,包括每个基因表达变化的大小及其在特定途径中的位置。与其他现有技术相比,这提供了更高水平的途径特异性生物分析,这使得结果更有意义。通路影响分析揭示了两个重要的途径,白细胞跨内皮迁移。
计算机辅助制造在脊椎动物细胞的细胞生长,细胞迁移和细胞分化的所有方面都很重要。它们涉及许多细胞功能,包括信号转导,细胞通讯和识别,胚胎发生,炎症和免疫反应以及细胞凋亡。计算机辅助制造的失调通常与癌发生有关,特别是肿瘤侵袭。例如,钙粘蛋白基因是计算机辅助制造的成员,被认为是肿瘤抑制基因。钙粘蛋白家族的成员E-钙粘蛋白介导细胞接触,并作为上皮细胞侵袭和转移的重要抑制因子。在另一项研究中,在低分化的头颈部人类鳞状细胞癌中被观察到失调,其表达与淋巴结转移呈负相关。除了鉴定钙粘蛋白连环蛋白复合物在上皮细胞 - 细胞粘附和维持组织结构中至关重要外,还发现该复合物的表达与肿瘤细胞的侵袭呈负相关。
在以前的研究中,已经报道了降低与肿瘤浸润在食管鳞状细胞癌,结肠直肠癌,肺癌和口腔鳞状细胞癌。在本研究中鉴定的这六种侵入相关基因可以作为垂体腺瘤中的新型诊断或治疗生物标志物。但是,需要进一步的研究。
这些基因在侵袭性垂体腺瘤中显着失调,并且可以作为治疗侵袭性垂体腺瘤的潜在诊断或治疗生物标志物。但是,需要进一步的研究来验证目前的研究结果。
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